مهدي نصيري كتاب صبح اين اثر با استناد به آيات و روايات در ۹ بخش سامان يافته است: در بخش اول، بحث نقد فلسفه از نظر قرآن و عترت شرح داده شده است. در بخش دوم موضوعات «عقل فلسفي و ديني»، «استدلال عقل در فهم پاره‌اي از حقايق»، «نياز عقل بر هادي و رهنما»، «عقل مفهوم‌پرداز فلسفي يا عقل فضيلت‌پرور قرآني؟»، پرداخته شده است. «نسبت فلاسفه يونان با نبوت و ديانت»، «هم‌ترازي فلسفه و نبوت»، «ملاصدرا و كفايت عقل پس از ختم نبوت» از مهم‌ترين موضوعات مطرح شده در فصل سوم است. در فصل چهارم، «خاستگاه علم و حكمت»، «پاسخ فلسفه»، «پاسخ اهل بيت» و ... مورد بحث و تبيين قرار گرفته است.«اهميت اعتقاد به معاد جسماني نزد عالمان ديني»، «نفي معاد جسماني از سوي فلاسفه»، «ملاصدرا از معاد روحاني به معاد جسماني»، «معاد از منظر قرآن و عترت» و ... از مهم‌ترين سرفصل‌هاي مطرح شده در فصل پنجم است. «ظاهر و باطن»، «حقيقت دوگانه»، «نمادين بودن نصوص ديني»، «موضع قرآن و عترت درباره تأويل و ظاهر و باطن»، مهم‌ترين مباحثي هستند كه در فصل هفتم بررسي شده اند. در فصل هشتم، موضوعات: «اختلاف در مورد حقيقت خداوند»، «ظهور سوفسطائيان»، «وجود اصيل است يا ماهيت؟ن، «اتحاد عاقل و معقول» و ... ،مورد تحقيق و مطالعه قرار گرفته است. « آيا عقل يعني فلسفه؟»،« مخالفت با فلسفه خود فلسفه است؟»، «آيا دين براي دفاع از خود نياز به فلسفه دارد؟ از موضوعات مهم طرح شده در فصل آخر است.